Curso de Espectroscopia em herbário com MicroNIR

Teoria e prática

Apresentação

Sejam bem-vindos(as)!😊

Este curso foi desenvolvido para capacitar funcionários e bolsistas no uso do espectrômetro portátil MicroNIR, abrangendo desde a configuração inicial do equipamento até a análise dos dados espectrais.

Ao longo de três dias de atividades teóricas e práticas, os participantes explorarão os fundamentos da espectroscopia no infravermelho próximo (NIR) e sua aplicação na identificação de plantas.

Além disso, o curso busca identificar desafios práticos no uso do equipamento, contribuindo para o desenvolvimento de um protocolo de aplicação no âmbito do Projeto SpectraPop.

Detalhes do curso

Onde: Herbário INPA (1º andar, Sala IFN), Av. André Araújo, 2.936 - 69067-375 - Petrópolis, Manaus, Amazonas.

Data: De 02 a 04 de abril de 2025.

Público-alvo: Funcionários e bolsistas envolvidos no fluxo de trabalho do herbário que tenham interesse no uso de espectroscopia portátil para pesquisa científica.

Número de vagas: 13 (participantes previamente selecionados).

Carga horária: 18h (com emissão de declaração de participação).

Formato: Híbrido, com aulas teóricas virtuais e aulas práticas presenciais. Quatro laptops estarão disponíveis para as aulas práticas, e as atividades serão realizadas em quatro grupos.

Material: Slides, scripts e dados obtidos durante o curso serão disponibilizados diretamente aos alunos ou via GitHub.

Observações importantes:

  • Participantes externos devem apresentar um documento de identificação com foto (p. ex. RG) e informar em qualquer portaria do INPA que estão participando de um treinamento no Herbário INPA.

  • Para as aulas teóricas, os participantes podem assistir de casa ou utilizar as dependências do INPA. Se este último for o seu caso, por favor, avise-nos com antecedência.

  • Ao final do curso, cada participante deve responder um formulário de aproveitamento para avaliação da capacitação e sugestões para aprimoramento do protocolo de uso do MicroNIR, que futuramente será disponibilizado para toda a comunidade interessada.

Cronograma

Visão geral

As atividades do workshop ocorrerão durante três dias seguidos, de quarta a sexta-feira.

As sessões da manhã serão entre 09h00 e 12h00 (horário padrão do Amazonas).

As sessões da tarde serão entre 14h00 e 17h00 (horário padrão do Amazonas).

Linha do tempo

Dia 1 (quarta-feira)

Manhã (Flávia)

Fundamentos teóricos da espectroscopia NIR e suas aplicações

Link para acessar a aula: https://meet.jit.si/Spectrapop

Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/PTZiQRaphvAgcDwu7

Vídeo Tour do Espectro Eletromagnético (NASA): https://www.youtube.com/watch?v=2p7FPFvu_j0

Tarde (Caroline)

  • Apresentação do dispositivo NIR-S-G1 (MicroNIR, InnoSpectra Corp.) e acessórios

  • Configuração do aplicativo ISC-NIRScan GUI (laptop e smartphone)

  • Calibração, coleta de dados espectrais e cuidados necessários na obtenção dos espectros

  • Entendendo os arquivos de saída

Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/7Y52iFG1BNhstmey6

Dia 2 (quinta-feira)

Manhã (Caroline)

Exercício prático de aquisição de leituras espectrais - Exemplo com algumas das espécies CITES (Convenção sobre o Comércio Internacional das Espécies Silvestres Ameaçadas de Extinção) listadas abaixo:

Id Família Espécie
1 Bignoniaceae Handroanthus barbatus
2 Bignoniaceae H. capitatus
3 Bignoniaceae H. impetiginosus
4 Bignoniaceae H. incanus
5 Bignoniaceae H. ochraceus
6 Bignoniaceae H. serratifolius
7 Bignoniaceae Tabebuia aurea
8 Bignoniaceae T. insignis
9 Meliaceae Cedrela odorata
10 Fabaceae Dipteryx magnifica
11 Fabaceae D. odorata
12 Fabaceae D. polyphylla
13 Fabaceae D. punctata

Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/ucjn7CXmNSVrbKdH7

Tarde (Caroline)

  • Instalação das bibliotecas necessárias

  • Como importar as leituras espectrais para o R

  • Como visualizar espectros e avaliar a qualidade dos dados espectrais

  • Como preparar os conjuntos de dados para análise

Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/WnXsJYpzR1aw5kxT8

Dia 3 (sexta-feira)

Manhã (Flávia)

Fundamentos teóricos da espectroscopia NIR e suas aplicações

Link para acessar a aula: https://meet.jit.si/Spectrapop

Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/j6JUzh1RKtncAZT67

Tarde (Caroline)

  • Análise discriminante (LDA) com validação cruzada Leave-One-Out (LOO)

  • Avaliação básica dos modelos (acurácia e matriz de confusão)

  • Responder formulário de aproveitamento do curso

Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/BtVwHsepLdAKL55R7

Link para acessar acessar o formulário de feedback: https://forms.gle/jFX8RhJp2MVVybRa9

Equipe de organização e treinamento

Profa. Dra. Flávia Durgante (Coordenadora do Projeto SpectraPop), KIT/ MAUA/INPA

Dra. Caroline Vasconcelos (Bolsista AT/III do Projeto SpectraPop), INPA

Prof. Dr. Michael Hopkins (Colaborador), Curadoria do Herbário INPA

Financiamento

Este curso é parte do Projeto “Popularização do uso da Assinatura Espectral da Espécie na identificação das árvores do Manejo Florestal Sustentável na Amazônia - SPECTRA POP”, financiado pela Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM), Edital no. 006/2024 - Mulher Faz Ciência (Processo no. 01.02.016301.04984/2024-17), e apoiado pelo Herbário INPA via Chamada pública MCTI/FINEP/FNDCT no. 02/2016 – Centros Nacionais Multiusuários.

Participantes

Participantes do 1º Curso do Projeto SpectraPop, Herbário INPA, abril de 2025.